男性，46岁，农民，反复多关节肿痛伴晨僵6年，诊断为类风湿性关节炎，长期服中药和芬必得等消炎止痛药治疗，仍逐渐出现双手掌指关节半脱位和尺侧偏斜，近1年关节疼痛加重，尤右膝关节明显，行走困难并出现反复上腹疼痛，空腹及夜间明显，6个月前曾呕吐过咖啡样物。查体：上腹部轻压痛，右手第3及左手第2、3近指关节肿，右膝关节肿胀.屈曲畸形。X线示右膝关节多处骨质增生，关节间隙消失，化验大便潜血(+)。请回答下列问题：

患者上腹疼痛的主要原因是什么?为明确上腹痛病因，首选的检查是什么?类风湿性关节炎治疗原则?患者经内科正规治疗后仍行走困难，生活不能自理，家属要求手术治疗，最好采用什么治疗?